Model recapitulates regenerative limb blastema formation through local softening of the wounded epithelium
该研究通过结合新型混合代理计算模型与实验验证，揭示了伤口上皮局部软化以及 Wnt 信号通路介导的间充质细胞定向迁移是驱动脊椎动物肢体再生芽基形成的关键机制。
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developmental biology
274 篇论文
Drosophila germ band extension: a two-state reshaping mechanism
该研究通过实验约束的生物物理建模揭示，果蝇胚带延伸采用了一种“双态重塑”策略：前部组织在波动肌动球蛋白应力作用下呈流体态并发生弱收敛延伸，而后部组织则在外力诱导下形成类晶体有序结构并通过快速塑性流动完成包裹，从而协同解决胚带重塑的异质性挑战。
Hormonally responsive bovine oviductal organoids recapitulate native oviductal secretions and enhance sperm capacitation
该研究成功建立了具有激素响应性的牛输卵管上皮类器官，其分泌的体液在分子特征和功能上（如促进精子获能）均能高度模拟天然输卵管环境，为研究生殖生物学及改进辅助生殖技术提供了可持续且生理相关的平台。
ATF4 and EcR interact to mediate both transcriptional activation and repression in the Drosophila fat body
该研究利用果蝇脂肪体模型揭示了应激因子 ATF4 通过与类固醇激素受体 EcR 相互作用（并竞争性取代其经典伴侣 Usp），在营养充足时协同激活脂质代谢基因并抑制脂肪分解酶，从而在稳态与应激条件下实现特异性转录调控的分子机制。
Placental prostaglandin signaling disrupts barrier integrity and relays an acute inflammatory signal to the fetus.
该研究揭示母体炎症通过诱导胎盘产生前列腺素 E2 破坏血胎屏障完整性，并将急性炎症信号传递至胎儿，从而为产前神经发育障碍提供了关键的机制解释及潜在治疗靶点。
Adaptation to climate driven environments in a Patagonian suboscine passerine
该研究通过分析巴塔哥尼亚北部普孔和南部纳瓦里诺岛两个种群的刺尾雷亚鸟（Thorn-tailed Rayadito）数据，揭示了温度、降雨和风速等气候变量在不同地理环境下对雏鸟孵化体重、生长速率及离巢体重的差异化影响，并发现尽管孵化体重逐年下降，但生长速率和离巢体重并未受显著影响，从而为预测气候变化下鸟类适应性与生存威胁提供了重要依据。
Ciliary cAMP regulates Shh signal interpretation to drive polarisation of differentiating neurons
该研究通过长时程活体成像揭示，神经元分化过程中初级纤毛内 Smo 与 GPR161 的平衡调控纤毛 cAMP 水平，进而抑制 Gli 转录因子激活并调节肌动蛋白动力学，从而确保 Shh 信号的正确解读及神经元极性建立。
BMP antagonism is required for mandible outgrowth in zebrafish
该研究表明，在斑马鱼中，BMP 拮抗剂（如 Grem1a、Nog2 和 Nog3）通过调控软骨细胞分化与软骨组织有序性来维持梅克尔软骨的持续生长，从而支持非哺乳类脊椎动物下颌的发育。
An alternative patterning mechanism for vertebrate tooth complexity
该研究通过整合比较发育分析、三维形态测量、突变扰动及贝叶斯逆建模，揭示鳞龙类多尖牙的复杂形态并非依赖哺乳动物特有的釉结离散组织者，而是由一种持续存在的广域上皮信号场通过增殖驱动形成，这一发现确立了脊椎动物牙尖形成的替代性模式架构，并表明哺乳动物的釉结机制实为一种衍生且受限的特化实现。
Functional redundancy between UTY and UTX in regulating the localization of transcription factors involved in pluripotency
该研究揭示了 Y 染色体基因 UTY 与其同源基因 UTX 在人胚胎干细胞中通过不依赖去甲基化活性的冗余机制，协同维持染色质可及性并促进核心转录因子（如 OCT4 和 SOX2）的正确招募，从而保障多能性状态的稳定。
PPARG directs trophoblast cell fate and establishment of the uterine-placental interface
该研究证实过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPARG）是人和大鼠中保守的关键调节因子，它通过驱动滋养干细胞的定向分化，对建立子宫 - 胎盘界面及诱导子宫重塑至关重要。
Cardiomyocyte-intrinsic SLC25A1 regulates cardiac differentiation and mitochondrial function
该研究通过小鼠和人类诱导多能干细胞模型证实，线粒体柠檬酸转运蛋白 SLC25A1 是心肌细胞内在的关键调控因子，它通过连接柠檬酸输出与发育基因程序，调控心肌细胞分化、线粒体成熟及心室形态发生，其功能缺失会导致先天性心脏畸形。
EmbryoTempoFormer: clip-based developmental tempo inference from zebrafish brightfield time-lapse microscopy
本文提出了 EmbryoTempoFormer，一种基于时间序列片段（clip）的 CNN-Transformer 模型，能够从斑马鱼明场延时显微图像中推断发育节奏，并通过以胚胎为独立单位的统计工作流，在温度扰动等条件下实现对发育动态变化的稳健量化与可解释性比较。
A high-throughput assay quantifies thermal scaling of Drosophila development with minute-scale precision
该研究开发了一种基于发光检测的高通量实时测定法，能够以分钟级精度量化果蝇幼虫发育的热缩放规律，揭示了发育阶段的模块化特征及温度对发育时序的调控机制。
Description of the embryonic development in the convict cichlid (Amatitlania nigrofasciata)
本文详细描述了在 26°C 条件下，从受精到孵化（约 70 小时）的慈鲷科鱼类黑带慈鲷（*Amatitlania nigrofasciata*）的胚胎发育全过程，提供了基于硬骨鱼类参考框架的实用分期表，并记录了包括卵裂、原肠作用、体节形成及器官发生等关键阶段的时序特征与形态学细节。
DEVELOPMENT OF A BIOMIMETIC 3D OVARIAN SCAFFOLD USING DECELLULARIZED EXTRACELLULAR MATRIX AND MECHANICALLY TUNED HYDROGELS
本研究通过结合机械性能调控的水凝胶与去细胞化卵巢细胞外基质，成功构建了仿生区域特异性3D卵巢支架，显著提升了细胞活力并模拟了天然卵巢组织的机械与生化特性，为卵巢组织再生医学及体外模型开发提供了新策略。
Division of labor between ERK and Notch signaling coordinates distinct stem cell populations during jellyfish tentacle regeneration
该研究发现，在水母触手再生过程中，ERK 信号通路特异性地驱动修复性增殖细胞（RSPCs）形成胚基，而 Notch 信号通路则调控居间稳态干细胞（RHSCs）的增殖与分化平衡，两者分工协作实现了对不同干细胞群落的时空协调控制。
Luminal epithelium remodeling underlies endometrial regeneration during menstruation and pregnancy
该研究揭示了小鼠子宫内膜在月经和妊娠期间的再生并非依赖传统认为的腺体细胞补充，而是由腔上皮通过独立的祖细胞群进行大规模扩张和形态发生，从而在基质破坏的同时实现再上皮化，这一机制解释了子宫内膜抗纤维化的卓越韧性。
ARHGEF6-dependent cytoskeletal regulation underlies a conserved program of forebrain interneuron development
该研究通过小鼠和人类类器官模型证实，ARHGEF6 作为 Rho GTP 酶依赖的细胞骨架调节因子，在跨物种中保守地调控前脑中间神经元的迁移、存活与成熟，其功能缺失会导致抑制性回路发育异常并引发智力障碍。
Apical spectrin organizes cortical actin filament bundles to pattern C. elegans cuticle ridges
该研究发现，秀丽隐杆线虫的顶端βH-血影蛋白（SMA-1）通过组织皮层肌动蛋白丝束来调控富含胶原蛋白的表皮脊（alae）的形态发生，其缺失会导致肌动蛋白网络紊乱及细胞外基质脱离，进而破坏中脊的形成。